Le voyage en Amérique latine dure plus de deux ans, il est pavé de succès et de rencontres merveilleuses. Toutes les peintures réalisées à partir de Madeleine posant et de photographies d’indigènes sont achetées par les meilleures collections. Après une halte sur la côte Ouest des États-Unis, ils atteignent le Japon en novembre 1933 avec un joli pécule et s’installent à Tokyo où peu après Foujita fait bâtir une maison de style mexicain dans le jardin de sa sœur.

Le grand magasin Sogo à Osaka et le grand café Colomban de Tokyo lui confient la réalisation de deux peintures monumentales à la française. Foujita excelle dans ce style si exotique au Japon. Madeleine, qui est retournée quelque temps en France va avoir la mauvaise surprise d’y apprendre que, en son absence, Foujita fréquente à Tokyo une jeune et jolie japonaise.

Dès son retour, leurs rapports se dégradent, ils voyagent en Chine, Foujita participe à l’exposition « Dix grands maîtres de la peinture occidentale » organisée par le magasin Shiseido de Ginza, réalise deux décors à Kyoto, l’un pour le grand magasin Marubutsu, l’autre pour l’Institut franco-japonais du Kansai tandis que Madeleine se produit et s’étourdit au théâtre Takarazuka. La jeune japonaise, Kimiyo Horiuchi, s’occupe de la maison, En juin, Madeleine meurt brutalement à Tokyo, elle n’a que trente ans, les stupéfiants et l’alcool ont eu raison d’elle.

Afin de trouver un dérivatif à sa douleur, Foujita se lance à corps perdu dans le travail, il relève un défi lancé par le collectionneur Hirano Seikichi, de peindre le plus grand tableau du monde (3.65 X 20.50 m), le sujet en sont les Fêtes des quatre saisons d’Akita qu’il réalise en seulement 174 heures.

Un séjour salutaire à Okinawa réintroduit la couleur dans les sujets, paysages et scènes paysannes de la vie de l’île, telle qu’il l’avait maniée en Amérique latine.

En septembre, Foujita épouse Kimiyo ; il a reçu l’ordre du ministère de la Marine de suivre les combats qui se déroulent en Chine en qualité de peintre attaché aux armées. Foujita réalise des croquis de batailles et plus tard l’huile sur toile intitulée L’Embrasement du nouvel aérodrome de Nanchang.

Les Allemands aux portes de Paris, Foujita et Kimiyo embarquent sur un paquebot qui part de Bordeaux le 23 mai avec tous leurs amis japonais. Le code de l’honneur et son père le rappellent à Tokyo, où il est nommé chef des peintres officiels de l’Armée de terre de la Grande Guerre d’Asie.

Le général Foujita meurt en mai. En juillet, Foujita devient membre de l’Académie impériale des beaux-arts Teikoku Geijutsu. En octobre, nommé par l’Académie et l’Association pour la promotion de la culture internationale, il est envoyé en Indochine française en qualité d’attaché culturel. Il est chargé d’organiser une exposition à Hanoi (Vietnam), puis en décembre à Phnom-Penh (Cambodge).

En mai, la Marine l’envoie sur le front du Pacifique Sud comme officier et chef du groupe de peintres officiels. Il participe à de nombreuses expositions consacrées à la guerre et à l’armée japonaise et publie un essai intitulé Nager sur la terre.

En janvier, il reçoit le prix de la culture du journal Asahi shimbun.

À la fin de l’année, il quitte Tokyo et s’installe avec Kimiyo et quelques amis peintres dans le petit village de Hobuchi-Mura dans les montagnes de Kanagawa.

Le 13 avril, sa maison et son atelier sont détruits dans le bombardement de Tokyo.

En février, Foujita et Kimiyo sont rejoints par les troupes d’occupation américaines qui les ramènent avec leurs amis dans la capitale dévastée. La « Section des Beaux-arts et des artistes » dirigée par Frank Sherman sous les ordres du général Mac Arthur va être d’un grand secours pour Foujita. Visé par un règlement de comptes émanant de ses anciens collègues peintres des armées, il est soutenu par un journaliste français Georges Grosjean et Frank Sherman qui ont tous deux connu Foujita à Montparnasse et sont persuadés de son innocence. Foujita souhaite quitter définitivement le Japon. Ses amis vont œuvrer pour lui obtenir un visa de sortie. Ce sera long et pénible pour lui et surtout sa femme, jeune et fragilisée par les événements.

En mai, Foujita présente Mon rêve à l’exposition d’art contemporain de Tokyo. A l’automne, il envoie des œuvres à New York où lui sont consacrées deux expositions personnelles dans les galerie Kennedy et Manhattan. Ces expositions reçoivent une critique favorable. Il est également membre du jury du Salon académique Nichiten et dessine des couvertures pour la revue Josei et Fujin Koron.

En octobre, il participe avec Mon atelier (1936) à « l’Exposition totale d’art moderne du Japon ». En novembre, la galerie Shiseido à Ginza lui consacre une exposition.

Foujita côtoie l’entourage du général Mac Arthur et se réfugie le plus souvent au QG américain. L’attente est longue, il a perdu le goût de la peinture.